本校前身是創立於民國54年健行工商專校,創校之初設有土木工程、電訊工程、建築工程及工業管理等四科六班,經逐年擴展,於83學年度改制為「健行工商專科學校」,88學年度改制為「健行技術學院」,89學年度更名為「清雲技術學院」。
92學年度奉核改名「清雲科技大學」,101年8月奉准恢復校名為「健行科技大學」。
目前計有16個系、1個學位學程、10個研究所。
創校以來,培育術德兼備之有為青年無數,在董事會及歷任校長領導擘劃下,不斷增建校舍,充實設備,延攬優秀之國內外學人來校執教,加強師資陣容,期能質量兼顧,開創宏觀的新紀元。
本校依據辦學理念與願景,擬定發展目標與策略,落實各項中程校務發展計畫,發展學校特色與優勢,在教學、研究、輔導及校務行政的推動上,結合校訓「好學有禮」,並形塑「有禮」的校園文化,讓健行科技大學成為教職員工的幸福職場,以身教及境教培養學生的職場倫理與工作態度,並發展成優質的一流大學。