食品保健系之教學目標以培育具備製造、管理、檢驗分析、行銷與創新能力之食品保健專業人才。在教學規劃上講求理論與實務並重,學術研究與專業技能兼具,以期培養出具學術理論與實務證照之高級專業技術人才,落實技職教育理念,貫徹「學、考、用」三合一政策。本系透過「保健食品製造技優人才培育計畫」,獲教育部補助二千萬金費,更新實習設備,建置保建農、漁產品加工實習工場及專業乙級考場,並藉由系本位課程修訂、外師授課及全時實習,將保健食品產業所需實務技能帶入校園,輔導學生熟練專業技能,精進實作能力,利用在地特色農、漁產品,開發成高單價之保健食品,提高農漁民收益,藉此模式建構保健食品產業價值鏈,開創傳統農、漁產業新生命,而學生亦可達到產學無縫接軌、學習即實習、畢業即就業之目標,如此不但可解決食品傳統產業嚴重缺工問題,賦予傳統產業新的活力動能,更可促進產業升級,為臺灣經濟發展帶來一番清新氣象。