本系為培養學生學習及研究日本語文能力，進而造就專業人才，於民國83年奉准成立，為國立大學中首設之日文系。並為延續且落實學士班教育目標，培養具專業日文素養及國際觀之多元人才，於民國92年成立碩士班。 學士班 教育目標: 本系對於學生的培育目標，在學士班方面主要以具備日本語文專業素養，通曉日本語言學（日語教育）、日本文學（文化）之基礎知識，進而具備人文素養及獨立思考能力，熟知日本國情、兼具宏觀的國際視野，造就提升台日關係多領域之專業人才為目標。 核心能力: a.培養學生具備日語聽、說、讀、寫、譯等五項技能，落實本系之教育目標。 b.培養學生具備人文素養及獨立思考能力。 c.培養熟知日本國情，兼具國際宏觀視野之優秀人才。 d.落實校內輔系、雙學位的制度，培養多領域之專業人才。