本系課程特色如下：1.音樂專長特色：配合課程教學，發展精緻小型樂團如「薩克斯風重奏團」、「長笛室內樂團」、「銅管室內樂團」、「木管室內樂團」、「人聲合唱團」、「弦樂重奏」、「打擊樂團」，並以「音樂快閃」不定時機動演出方式，培養學生溝通、團隊合作及演出之能力。2.原住民音樂特色：招收原民音樂人才學生，採獨招與名額外加方式，招收具有音樂專長之原住民學生，發展原住民音樂特色。3.音樂數位媒材應用：電腦音樂、數位媒體、混錄音工程、數位編曲、流行音樂編曲等課程之開課，培養學生第二項專長與技能。4.音樂教學能力：開設音樂教學法相關課程，包括歌唱教學法、鋼琴教學法、亞歷山大教學等，加強「藝術與人文領域」教學能力之培養。5.小學教育學程：鼓勵選修小學教育學程，培養藝術與人文領域教師。6.藝術文化機構之合作和服務：與臺東縣政府、生活美學館、美術館等單位合作辦理志工服務及藝文活動，增加學生實習和就業的機會。