培養學生具備化學與生化科技領域之知識與技術，整合化學技術基礎，開發化學工業、植物生技、農業製劑、妝藥製備與分析及品管等關鍵技術為主軸，提供理論與應用兼具之專業課程，使學生畢業後能順利銜接升學與就業生涯，具備通才的實務技術與獨立應變能力。課程以應用化學為基礎，著重「有機特化」、「分析技術」核心，並結合實用性「產品檢驗」與「實務應用開發」，輔以多面向生化科技專業選修，開設「專題研究」與「企業學程」課程以強化專業知識與實作能力。 教師結合產學合作，透過個案講座、企業參訪、競賽、證照、服務學習與專題製作等課程活動，引領學生掌握業界現況與產業需求，印證課堂所學。簽訂產學合作計畫，進行教學與實習合作，學生可在大學四年中，獲取工讀與實習機會，提升專業實務能力。本系設置「安全農業與精緻量產技術研發中心」，透過「費洛蒙中心」、「亞洲穀物檢驗中心」及「健康種苗中心」三項平台，積極整合資源，發展產學合作。