管中閔於2018/1/5打敗熱門人選陳弱水、周美吟等人，以黑馬之姿成為台大新校長，然而在當選後爭議不斷，因擔任台灣大哥大獨立董事一職，遭批事先未充分揭露資訊，引發台大校長遴選作業未做好「利益迴避」的輿論；更有台大教授坦言，事前不知道管中閔是台灣大領高薪的獨董，擔憂未來台大校務推動恐將獨厚特定財團。
管中閔則是發佈聲明，表示在遴選會議完，確認成為校長當選人的隔日，他已即向台灣大董事會請辭獨立董事職務，並將卸除所屬學會理事長與所有非營利基金會董事職務。
教育部已針對「獨董身分未揭露」的爭議去函要求台大回覆，若要檢討缺失，除了管中閔本人外，台大遴選委員會及人事室皆無一倖免。
一位台大不願具名的遴選核心人士提出幾點質疑......
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